巴彦淖尔市康复科(巴彦淖尔市残疾人康复中心) ，由康复医学科、脊柱外科、心脏康复科、神经康复科、中医科组成，系医院整合构建的“八大中心”之一。2016年被自治区医疗卫生计生委评审为领先学科、重点学科、重点实验室。也是内蒙古西部区最大的康复医学治疗中心、康复质控中心，并经巴彦淖尔市卫计委批准成立中医骨伤名医工作室。2017年，医院搬迁新址投资购置2500万新设备，引进国际、国内先进康复治疗技术和整体康复理念，真正实现了早期康复的全面介入。

巴彦淖尔市康复医学中心目前开展的现代康复技术项目如下：医学运动康复（MTT）技术、神经肌肉本体感觉促进（PNF）等异化技术、经颅磁刺激（TMS）技术、矫形器治疗技术、言语治疗、心理治疗、认知治疗、肉毒素治疗技术、肌骨超声下穴位注射、脊柱定向定位减压系统治疗技术、关节松动治疗技术、吊治疗技术、日式手法复位治疗、小儿脑瘫治疗技术等。

巴彦淖尔市康复医学中心还能开展冲击波、超声波、超短波、微波、高频、中频、低频、颈椎电动牵引治疗、腰椎电动牵引治疗等物理治疗以及推拿按摩、精准针灸、头针、芒针、小针刀、热敏灸疗法、雷火灸疗法、蜡疗等传统特色的中医康复治疗技术。

巴彦淖尔市康复医学中心组成科室之一-------康复科现有住院床位50张，门诊床位42张。全科医护人员共87人，其中，主任医师2名、副主任医师8名、主治医师18名、康复医师5名、康复治疗师36名、言语及心理治疗师各6名，康复护师12名。主要开展四方面的康复治疗工作：⑴.疾病的早期康复；⑵.疾病的中后期的功能与结构重塑；⑶.急慢性病的非药物治疗；⑷.重症康复。业务范围包括：神经系统的康复、骨关节的康复、颈肩腰腿疼痛的康复治疗、内科疾病的康复、儿科康复，妇科康复、肿瘤康复等。