北京医院药学部为院长直接领导下的医院药学技术部门。随着北京医院药学事业的提升与发展，药学部不仅是药品保障的职能科室，也是集政策性、专业性、学术性、技术性、管理性和经济性为一体的综合管理和技术部门，担负着医院合理用药的重任。 药学部下设调剂室、药品供应室、药品质量检验室、临床药理室4个二级技术科室，分别开展药品供应、调剂、静脉药物集中配制、制剂生产、药品检验、临床药学、I期新药研究、药事管理等业务技术工作。

　　药学服务是药学部工作的根本，调剂室全面实施了药品计算机网络化管理，在改变工作模式、优化药学服务流程、降低药品使用风险、加强药房信息化、自动化建设等方面开展工作，全面实施“以患者为中心”和“全程化药学服务”的宗旨。新开展的静脉药物集中配制工作，通过严格的处方审核、洁净的配制环境及严格的操作流程，以保障患者的用药安全。 药品供应室紧紧围绕 “以高干保健为中心”，保证药品质量、满足临床用药开展工作，实现各项工作的法制化、规范化、科学化、信息化这一工作宗旨，与时俱进，积极开展各项工作，为临床提供满意的服务。 药品质量检验室承担着高干保健及全院用药的检验工作，已通过CNAS实验室认可和国家计量认证双认证，药品检验能力位于国内医院前列，是北京医院药学部的独特优势。在建立质量管理体系，有效的保证药品的质量安全发挥重要作用，为医院树立了药品质量过硬的信誉。 制剂室结合老年病的治疗特色，开发医院特色制剂，其中维生素E乳、复方甘油止痒乳、祛痰合剂等已成为享誉全国的“名牌”药品。 药学部I期新药研究工作已达到国内先进水平，其硬件设施、人才梯队、研究水平均得到长足地发展。目前为国家科技部资助的全国26个GCP平台之一，与多家国际知名药品研发公司建立合作关系，承接药物I期临床试验项目。 药学部临床药学工作始终走在全国同行业的前列。1978年药师开始到临床开展工作，1985年开展TDM药物监测，1991年被卫生部批准为全国临床药学（16家）基地。建立了北京医院特有的工作模式，并全面实施和推广。目前10名临床药师分别在内分泌科、心内科、呼吸科、神经内科、风湿免疫科以及血液科开展临床药学工作，全程跟踪患者用药、审核医嘱并建立药历；根据病情分析用药合理性，对患者进行用药教育等。有独立的门诊药物咨询室，出版药学通讯，宣传合理用药，带动医院内药物不良反应监测。开展的药物风险评价和药物警戒工作在国内有一定的影响，多次得到国家及北京市的表彰。 2012年7月，卫生部北京医院在全国率先开展了药物基因多态性检测工作，建立了17种高危药物的用药建议报告系统。共接受了1350余名患者、14个基因、21个突变位点的检测，为临床调整药物治疗方案提供了依据和参考，也为药品说明书的修订积累数据，此项工作，在国内外都属领先水平，为个体化用药的深入开展奠定了基础。

　　教学和科研是药学部学科发展的充分体现，药学部是国家临床药学重点专科创建单位、国家药物临床研究基地、卫计委/北京市专科医师培训基地，北京大学、沈阳药科大学、山东大学硕士学位和博士学位培养基地，卫生部临床药师及师资培训基地，药学实验室通过17025实验室认证， 成为“药物临床风险评价与个体化用药北京市重点实验室”。 药学部每年国内核心期刊发表论文持续在60篇以上，已发表SCI论文近20余篇。承担国家“十二五”重大专项1项，国家自然科学基金3项，科技部“863”计划1项，北京市自然科学基金2项，北京市级课题2项。

　　药学部注重人才培养与团队建设，现有主任药师12人，副主任药师10人，博士12人，硕士13人，现有博士生导师1名，硕士生导师5名。药学团队在学历、高级职称数量的比例，以及常规的医院药学业务技术能力等方面处于国内较高水平。

　　岁月悠悠，苍河长流，北京医院药学部将围绕 “一流管理的实施、一流人才的发现、一流服务的体现、一流业绩的获得、一流文化的创造、一流环境的营造”及重点专科建设目标 “ 建立临床个体化药学中心” 开展工作，与北京医院共成长，与药学事业共荣光！