鹰潭市中医院内科分为内一科、内二科两个科室。

内一科是江西省省级中西医结合消化科、呼吸重点学科建设科室，现有主任中医师1人、副主任中医师1人、主治医师5人、硕士3人，目前开放床位66张，同时设有内镜诊疗中心，各类设施较全。目前科室已成为集临床、科研、教学为一体的重点科室，对内科常见、多发病的诊治有着较强的人才队伍和丰富的临床经验积累。

特别是在消化系统、呼吸系统常见多发及危重疑难疾病的中西结合诊治方面，科室积累了丰富而成熟的临床经验，已开展了常规胃肠镜下息肉切除、镜下止血等治疗，并开展了多项中医特色治疗，尤其是应用中药直肠滴入治疗溃疡性结肠炎；三伏贴调治慢性消化系统疾病、调治慢性咳喘方面领先于市内。

内二科主要负责心内科、肾内科、神经内科（中风科）、呼吸科、肿瘤科疾病、老年病科。

心内科主要包括：冠心病、心肌梗死、急慢性心衰、房颤、早搏、室上速、房速、房扑、室速、风湿性心脏病、缺血性心肌病、肥厚性心肌病等，常规开展了肌钙蛋白、尿钠肽测定。

肾内科主要包括：肾小球肾炎、肾病综合征，各种继发性肾小球疾病如系统性红斑狼疮肾炎、高血压性肾病、糖尿病性肾病、痛风性肾病、尿路感染(包括急慢性肾盂肾炎、膀胱炎等)，各种原因导致的急慢性肾功能衰竭等，开展了血液透析治疗、血液灌流、血液滤过。

神经内科（中风科）是省重点专科，主要包括：脑梗塞、短暂性脑缺血发作、脑出血、卒中二级预防(高血压、糖尿病、高脂血症、高同型半胱氨酸症等疾病治疗)、蛛网膜下腔出血、颅内静脉窦血栓形成、吉兰-巴雷综合征、多发性硬化、癫痫、重症肌无力、脑（膜）炎(病毒性、细菌性脑炎)、癫痫、帕金森氏病、痴呆、三叉神经痛、偏头痛、面神经麻痹、糖尿病周围神经病、颈动脉狭窄、眩晕症、抑郁症、失眠等，开展了腰椎穿刺及卒中单元康复治疗中心。

呼吸科主要包括：慢性阻塞性肺疾病、支气管哮喘、支气管扩张、肺部感染(细菌、病毒及真菌感染等)、急慢性支气管炎、气胸、胸腔积液、不明原因的发热等多种呼吸科疾病，开展了肺功能测定、闭式胸腔引流术(包括气胸、胸腔积液引流)，年完成胸腔闭式引流术50多例。

肿瘤科主要包括：各种肿瘤的化疗及中医中药等综合治疗，收治的病种包括肺癌、鼻咽癌、头颈部肿瘤、脑部肿瘤、乳腺癌、胃肠道肿瘤、肝癌、淋巴瘤等全身各种肿瘤，肿瘤化疗规范，对每位病人进行个体化治疗。

老年病科主要包括：各种老年人多发疾病的中西医综合治疗，收治的病种包括：慢性阻塞性肺疾病、冠心病、脑梗死、高血压、高脂血症等。