浙江大学医学院附属第二医院消化内科是浙江省消化病临床诊疗和教学科研的中心之一，现有博士生导师3人，硕士生导师8人；科室目前承担全省及其周边省市消化系统常见病及疑难、危重病的诊治工作。拥有国际最先进的奥林巴斯、富士能胃肠镜系列，电子超声内镜以及单气囊小肠镜、胶囊内镜系统，在消化内镜的诊治方面处于领先水平。

消化内科有以下几方面特色诊疗技术：

ERCP：开展ERCP（内镜下逆行胰胆管造影术）近20年，对急性重症胰腺炎，胆总管结石，恶性梗阻性黄疸等取得了良好的治疗效果。

ESD：在国内较早的开展内镜黏膜下剥离术（ESD）治疗，目前主要应用于胃、食管、结直肠的癌前病变，无转移的早期癌以及黏膜下肿瘤如类癌、间质瘤等的治疗。

HP：对幽门螺杆菌（HP）的治疗有丰富经验，相关科研处于省内领先地位；常规开展HP的各项检测包括呼气实验、HP培养等。

超声内镜：超声内镜可以确定胃肠粘膜下病变的性质和起源，判断消化道恶性肿瘤的侵袭深度和范围，诊断胆胰系统疾病等。目前已开展超声引导下细针穿刺等介入治疗。

炎症性肠病诊治：对炎症性肠病的诊治处于省内领先地位，已开展单气囊小肠镜、胶囊内镜等检查，并已开展“医、护、患”三方网络互动平台的使用。