锡林郭勒盟蒙医医院脑病科是以蒙医特色为主、结合现代医学，是临床、教学、科研为一体的临床科室。2012年经锡盟卫生局批准成为盟级重点专科、2015年经内蒙古卫生厅批准成为内蒙古自治区重点专科。脑病科全体医护人员团结一心，在院领导的指导下为创建国家级重点专科不断努力着。
脑病科由门诊及住院病区组成，建科30余年来，共有医护人员30名，脑病科门诊周一至周六上午为门诊患者诊治。脑病科病区有50个病床，并配备有抢救室、民族医药特色综合治疗室、三氧治疗室等特色治疗室。本科室拥有德国DWL经颅多普勒脑彩超机、德国卡特三氧治疗仪、示教室、各种抢球设备，民族医药特色器械（放血、针灸、艾灸等器械）等。
脑病科全体医师先后在吉林医科大学第一附属医院、首都医科大学附属北京世纪坛医院、内蒙古民族大学附属医院、包头医学院第三附属医院等知名医院长期学习进修。
脑病科现已开展脑血管介入检查、脑血管介入支架治疗等高端治疗。本科室对萨病（包括脑梗死、脑出血）、癫痫、高血压脑病、头痛、眩晕症、睡眠障碍、周围神经疾病、面神经炎、风湿及类风湿疾病能够系统诊治。