甘肃医学院附属医院血液科于2015年6月正式成立，成为陇东地区唯一独立的血液专科。2017年成立平凉市血液病专业委员会，马晓芸主任担任主任委员，学会多次邀请国内知名专家来院，开展学术交流。科室多名医师多次在全国知名血液科进修学习，各级医师积极参加线上线下学术会议。科室现有医护人员18名，医师6名，其中主任医师1人，副主任医师1人，副主任护师1人，主治医师4人，近年发表论文及科技进步奖数十项，目前开放床位58张。

科室常规开展急慢性白血病、多发性骨髓瘤、淋巴瘤、真性红细胞增多症、骨髓纤维化、原发性血小板增多症、再生障碍性贫血、缺铁性贫血、巨幼细胞性贫血、溶血性贫血、特发性血小板减少性紫癜、过敏性紫癜、血友病等疾病的诊治。近十年科室与北京海思特医学检验实验室密切合作，常规开展白血病MICM分型诊断、多发性骨髓瘤初筛及预后评估、骨髓增殖性疾病突变基因检测、血液肿瘤微小残留病灶检测、融合基因定量检测、FISH等项目，使我院血液病的诊断水平达到国内先进水平。在血液肿瘤治疗方面，擅长急性白血病的诱导及巩固治疗、慢性粒细胞白血病及淋巴瘤的靶向治疗、“硼替佐米联合来那度胺”治疗多发性骨髓瘤等。