甘孜藏族自治州人民医院病理科成立于七十年代，已有40多年历史，是目前我州唯一的综合医院的病理科，科室设置规范，有取材室、技术室、细胞学检查室、病理诊断室等。

科室目前具有较完备的常规病理仪器设备（取材台、脱水机、包埋机、摊烤片机、切片机、高级显微镜及图文报告系统，病理远程会诊系统），是华西病理科对口支援科室，并可直接与华西病理科进行病理远程会诊，能够完成临床各类各系统手术标本的诊断及细胞学诊断，承接我州其他县手术标本的诊断，每年完成组织学诊断5000多例，细胞学诊断2000例。