广东医科大学附属第二医院感染科，是湛江最早的医治传染性疾病的科室，特别是肝病的专科，已有80多年历史。该科现有医生4人；其中副主任医师2人，主治医师1人，住院医师1人。湛江市医学会感染病学分会第一届委员会副主任委员1名、湛江市医学会肝病学分会第一届委员会委员1名。

开设有感染科（肝病）门诊、发热门诊、肠道门诊、隔离病房，发热门诊是湛江市最早符合规范化建设的发热门诊。该科对各种肝病，特别是病毒性肝炎治疗有丰富和独到的经验。

感染科还承担湛江市传染病公共卫生事件处置工作、广东医科大学教学实习和湛江市全科医师培训工作。以第一作者发表的论文十多篇，湛江市科学技术局科研立项3项。