鄂尔多斯市蒙医医院消化病科（蒙医胃肠病科）是传统蒙医药、现代医学、消化内镜诊疗技术相结合，检查、诊断及治疗为一体的特色创新优势科室。下设康巴什部消化病科门诊、康巴什部消化内镜室、东胜部消化病科门诊等。消化病科坚持发挥蒙医药特色优势，以蒙医药为主，现代医学诊疗技术为辅，形成了传统与现代结合，蒙医与西医结合，优势互补的多学科一站式服务的鄂尔多斯市蒙医消化病中心。

科室医护人员先后在北京友谊医院、内蒙古医科学第一附医院、包头医学院第二附属医院、内蒙古自治区肿瘤医院，内蒙古国际蒙医医院等多家医院进修学习。参加了复旦大学附属中山医院、解放军中医院（北京301）、北京友谊医院、北京大学第一医院、内蒙古消化病研究所等多家医院的消化内镜诊疗技术手把手培训班及研修班。