赤峰市宁城县中心医院肛肠科是市级临床重点专科，北京中日医院肛肠专科医联体单位，中国医科大学附属第四医院肛肠专科联盟成员单位，北京中日医院专科医联体护理联盟肛肠护理专业组成员单位，内蒙古自治区中医肛肠专科联盟成员单位，赤峰市医药卫生学会医学分会外科分会结直肠肛管专科委员会副主任委员单位。2003年3月肛肠外科开展手术，患者入住于普外科病区。

2009年成立泌尿肛肠外科病房。2012年3月，肛肠外科病房从泌尿肛肠外科病房独立出来，正式成立肛肠外科病房。是集医疗、教学、科研为一体的中西医结合特色专科，科室以中西医结合为特点，以肛肠疾病诊治为重点，以微创手术治疗为特色，肛瘘、高位肛周脓肿、顽固性便秘等疾病的诊治享誉县内外。开放床位32张，年收治病人900余人，年门诊量4000多人次。