北京清华长庚医院儿科，成立于2014年，由晁爽副主任医师担任科副主任，在组建过程中，得到了清华大学、台湾长庚纪念医院和国内各兄弟单位的大力支持，科室现有主任医师1名，副主任医师1名，主治医师7名，住院医师5名，哮喘个案管理师1名，均毕业于国内外重点医学院校。

儿科门诊主要诊治16周岁以内小儿各种常见病、多发病及疑难杂症，并开设新生儿疾病、儿童肾脏疾病、儿童变态反应性疾病等专业门诊，提供高水平的专业化解决方案。

新生儿专业是儿科重点发展的亚专业，新生儿重症监护病房（NICU）技术力量雄厚，在新生儿严重感染、黄疸、窒息、颅内出血、缺氧缺血性脑病等危重疾病及早产儿呼吸管理、营养支持等方面具备丰富的诊疗经验，为缓解京北儿童住院难的压力，普通儿科病房已于2019年10月14日正式运行，收治各种儿童内科疾病。