安徽省立儿童医院儿内科现有主任医师4名，副主任医师2名，在诊治小儿腹泻，小儿慢性胃炎、消化性溃疡等上消化道疾病，再发性腹痛，婴儿黄疸等消化道疾病；小儿难治性肾病，不明原因的血尿等肾脏疾病。

小儿贫血，特发性血小板减少性紫癜，小儿白血病等血液系统疾病；心肌炎，心律失常等心血管疾病；小儿风湿热，幼年类风湿病，川崎氏病等结缔组织病及其他常见病、多发病、疑难病及危重症的抢救方面有独到之处，特别是所配备的药物、设备都是根据小儿不同年龄、不同需要购置或定做的，显示了儿童医院的特色。同时成功开展小儿胃镜、肾穿刺检查计达千余例。