安徽省儿童医院儿童血液肿瘤科成立于2008年，现为北京儿童医院血液肿瘤科技术合作科室，是医学发展儿童研究中心白血病、淋巴瘤等多学组成员单位。科室开设专科床位78张，其中医师15人，高级职称中主任医师2人，副主任医师2人，博士学位1人，硕士学位9人，年出院专科病人3000人次左右。

儿童血液肿瘤科医护专科技术力量雄厚，医院建有专科实验室，诊治小儿血液及肿瘤性疾病，如：白血病、淋巴瘤、肾母细胞瘤、神经母细胞瘤、肝母细胞瘤、横纹肌肉瘤等肿瘤性疾病。对血液系统疾病如免疫性血小板减少性紫癜，再生障碍性贫血，各种溶血性贫血，缺铁性贫血等具有丰富的经验。拥有安徽省儿童白血病治疗专家2位，是安徽省肿瘤专科护士、静疗专科护士临床教学实践基地。