北京市朝阳区中医医院针灸科为北京市中医管理局重点专科，设有住院部及门诊部。针灸科住院部主要收治脑梗死、脑出血、脑外伤恢复期、眩晕、面瘫、带状疱疹、颈腰椎病及术后恢复期患者。针灸科门诊治疗面瘫、带状疱疹、骨关节病、眩晕、头痛、更年期综合征等疾病。同时开设失眠、鼻炎、颈椎病、中风等特色专台门诊，专病专治，疗效卓著。

科室同时开展各类针刺，艾灸，火罐，药罐，穴位贴敷，耳穴压豆，热奄包，中药膏摩等中医特色治疗，及红外线照射，中频电治疗，脑循环治疗，电磁场治疗，超声离子导入治疗，放射式冲击波疼痛治疗等特色理疗。