宁化县总医院内镜室成立于2021年8月，设消化内镜组和呼吸内镜组。消化内镜组有主任医师1人，副主任医师2人，主治医师2人。呼吸内镜组有主任医师1人，主治医师3人。

内镜室拥有目前国家最先进水平的奥林巴斯CV-290电子胃肠镜以及奥林巴斯BF-P290、BF-1TQ290电子支气管镜，内镜主机系统3台，还有各种辅助治疗设备。

目前内镜室开展的项目有：

消化内镜组：无痛胃肠镜检查、胃肠道早癌的筛查、胃肠道息肉切除、急诊内镜下止血、消化道异物取出、胃空肠管放置等治疗。

呼吸内镜组：常规支气管镜检查、肺泡灌洗、刷检、活检、支气管异物钳出等。每年完成各项检查例数共300余例。