消化内科为杭州市中医胃病治疗基地、杭州市重点学科，与浙江省中医院合作成立消化学科博士工作站。科室配备医生10余名，其中名中医3名，主任医师2名，副主任医师4名 ，硕士研究生12名 。开放病床24张，科室投入1000余万元，建有集中医、西医、内科、外科、放射影像、超声、内镜各类临床诊疗技术于一体的大型的内镜中心（区胃肠病诊疗中心），配备完善先进的内镜诊疗设备，包括奥林巴斯290高清内镜，奥林巴斯 260高清内镜 ，富士FICE染色放大内镜，NBI+ME内镜，奥林巴斯超声内镜，奥林巴斯十二指肠镜。目前可开展常规的胃肠镜检查及内镜下治疗，EUS超声内镜检查及FICE染色放大内镜检查、无痛胃肠镜检查、ERCP等。

科室治疗特色鲜明，运用名老中医经验方，中西医两步法，中医内病外治法（穴位贴敷、拔罐疗法、艾箱灸、穴位埋线）等多种方法治疗慢性胃炎、消化性溃疡、慢性便秘、脂肪肝、慢性肝病等脾胃病较具特色。采用改良隔药灸法预防胃肠镜检查过程中出现的不良反应，效果显著，常年开展内镜下止血术、微创息肉摘除术、无痛胃肠镜检查术等。