福建医科大学附属协和医院眼科自创院以来，至今已有一百多年的悠久历史，已逐渐发展、壮大成为省级主要眼科医疗、教学、科研和防盲治盲中心之一。科室技术力量雄厚，仪器设备先进，突显专业特色。科室共有高级职称7人，12人具有硕士以上学位，眼科学博士生导师1人，硕士研究生导师4人，建有“福建省谢立信院士专家工作站”。

科室主任、学科带头人胡建章，医学博士，主任医师，教授，博士生导师及博士后指导老师，现任福建医科大学眼视光学系副主任，中国医师协会眼科医师分会青年委员，福建省眼科医师协会副会长，福建省海峡医药卫生交流协会眼科分会副会长，福建省医学会眼科学分会角膜病学组副组长。

科室专业齐全，其中角膜病专科、屈光手术专科、白内障专科、视网膜病专科、眼眶眼整形专科、眼底内科等是省内率先开展并已成为优势显著的特色专科。科室引进了当今国际先进的眼科诊疗设备，包括全球最先进的德国海德堡HRT3-CM共焦激光角膜显微镜、德国OCULUSPENTACAM三维眼前节分析仪、蔡司光学相干断层扫描仪（OCT）、欧堡免散瞳超广角激光扫描检眼镜、活体超声生物显微镜、三维眼科A\B超、科医人多波长激光等。

诊治绝大部分眼科常见病和疑难病，开展眼科大部分手术及治疗，包括角膜移植/羊膜移植治疗复杂性角膜及眼表疾病、飞秒激光视力矫正术、白内障超声乳化人工晶体植入术、多焦点人工晶体植入术、玻璃体切割治疗各种复杂性玻璃体视网膜病变、斜视矫正术、眼眶肿瘤切除术、引流钉及引流阀植入治疗复杂性青光眼、干眼的综合治疗、糖尿病视网膜病变的综合治疗、甲状腺相关眼病的综合治疗、泪道重建、眼部整形等。

眼科是福建医科大学硕士及博士研究生的学位授予点，是福建省内重要的眼科医师进修、规范化培训及继续教育基地，常年承担全省眼科医师培训任务，每年举办多种眼科学习班，为我省培养了大批优秀的眼科学人才。

注重科研工作，主持和承担多项国家自然科学基金项目及福建省科技厅、教育厅、卫计委等科研项目，在《Ophthalmology》、《InvestOphthalmolVisSci》、《ExperimentalEyeResearch》等眼科专业SCI杂志及《中华眼科杂志》、《中国实用眼科杂志》等国内核心期刊上发表多系列学术论著，学术研究成果得到国内同行的关注及应用。