福建医科大学附属第一医院药学部多年来积极探索医院药事管理与医院药学工作新思路，已建立起以患者为中心、以合理用药为核心的医院药学工作模式。开展治疗药物血药浓度监测、药物相关基因检测、药学门诊、用药咨询、药学会诊等临床药学服务以及个体化用药的基础与临床研究、I期临床药物试验等，为临床提供多元化的药学专业技术服务。

药学部下设药品供应室(西药库、中药库)、调剂室(西药房、中心药房、中药房)、制剂室、药检室、静脉用药调配中心、临床药学室(临床药学、实验室、信息室)、 I期临床研究中心、药学教研室等。2021年科室共有药学技术人员138人，其中高级职称 R31人，博士6人，在读博士2人，硕士36人。2018-2021年来承担国家级课题3项，省、厅级科研课题30余项;发表论文120余篇，其中SCI论文50余篇。I期临床研究中心顺利完成多项BE正式试验，累计经费1000余万元。

作为福建省临床用药质控中心、福建省抗菌药物临床应用监测网、福建省安全用药监5测网挂靠单位及福建省医学会临床药学分会、福建省医院协会药事管理分会、福建省药学会医院药学专业委员会主任委员所在单位，承担全省临床用药质量控制、促进药学学科。发展及临床药师培训基地管理与督导等任务。2021年福建省抗微生物药物临床应用与管理专家委员会成立，委员会办公室设干福建医科大学附属第一医院，药学部负责日常管理里工作。

科室先后获得中国医院药学奖、福建省总工会“五一先锋号”、中国药师职业技能大赛全国总冠军、亚军等荣誉。代表医院连续两年获得由国家卫健委医政医管局指导的全国医院擂台赛总决赛“拓展药学服务新领域”金奖案例，作为2018年-2020年改善医疗服服务先进典型受到国家卫健委通报表扬。2015年起连续获复日版“华东区医院最佳专科排行榜”临床药学专科提名，为我省唯一连续获此荣誉的医疗机构。2021年7月全省首个“ PCCM咳喘药学服务门诊全国示范中心”落户我院，继医师、药师联合门诊后开启了药师独立药学门诊的新篇章。2021年10月全省首个“国家抗菌药物管理(AMS)评价研究基地”落户我院，药学组也将继续做好抗菌药物合理用药工作。

此外，作为我省唯一、全国17家之一的国家临床药师培训和临床药师师资培训“双基”其地”创建以药学服务胜任力为导向的多层次临床药学专业人才培养体系，为临床药学专业人才培养发挥重要作用。科室临床药学专硕导师团队入选2019年省级专业学位研究生导导师团队建设名单;2020年专硕培养模式获医大教学成果一等奖，同年获批“全国药学专业学位研究生培养示范基地”。