福州市长乐区中医院消化内科设置内窥镜室、胃肠功能检查室。收治胃肠、肝胆、胰腺疾病以及不明原因的发热、腹痛、中毒等疾患。如：胃炎、十二指肠溃疡、胰腺炎等。

科室近年来开展了内镜下粘膜剥离术ESD治疗消化道早癌，粘膜隧道内镜下肿物切除术（STER）切除食管固有肌层肿瘤，内镜粘膜下挖除术（ESE）切除间质瘤。开展各种消化道恶性狭窄（食道癌、胃癌、十二指肠癌、胆管癌、结直肠癌）的支架植入治疗。

全面开展内镜下胆胰管微创技术（ERCP内镜下逆行胰胆管造影术）治疗胆胰疾病和超声内镜（EUS）诊断与穿刺技术（FNA，胰腺囊肿穿刺引流术等）。