福建省级机关医院眼科拥有主任医师1名、副主任医师1名、主治医师1名，医师1名、专科护士1名。擅长各种白内障、青光眼、各种眼表疾病、眼底病、小儿屈光、弱视等疾病的诊疗，尤其是中老年患者的白内障手术治疗及全身疾病（高血压、糖尿病等）的眼部并发症的诊治，螨虫性睑缘炎、干眼症等眼表疾病，儿童远视、近视及弱视的诊疗。

拥有德国蔡司最新一代光学相干断层扫描仪（同时具备视网膜血流成像功能）、德国蔡司眼底照相机、裂隙灯显微镜、电脑视野仪、A/B型超声诊断仪、日本托综合验光仪、日本角膜内皮镜以及德国蔡司手术显微镜、美国博士伦白内障超声乳化仪等先进设备，有助于各种眼部疾病的诊断。目前开展的手术包括：白内障超声乳化术、青光眼治疗手术、以及眼睑肿物，翼状胬肉，眼睑内、外翻，上睑下垂，泪囊炎等各种眼睑、眼前段手术治疗。