北京市平谷区医院病理科，创建于1977年，现有工作人员7人，副主任医师1名，主治医师1名，住院医师3名，病理主管技师1名，病理技士1名。现在病理科具有先进的病理设备，包括冰冻机、切片机、包埋机、脱水机、染色机及封片机、高清晰的显微镜6台、病理远程会诊系统1套。

病理科是平谷区的病理诊断中心，负责平谷区的术中冰冻、病理外检、脱落细胞的病理诊断工作。

病理科受到协和医院病理科的大力支持及帮助，协和医院负责北京市平谷区医院病理科的疑难病理会诊，现在可以通过病理远程会诊系统随时会诊。

数字切片的病理远程会诊系统是将病理切片通过系统扫描成数字切片，上传到网络平台，会诊专家随时可以在网上对数字切片进行会诊，会诊后将病理诊断报告通过网络传回提出会诊的医院（北京市平谷区医院），北京市平谷区医院就可以直接打印专家的会诊报告。该网络有全国各地的著名会诊专家数十名，也可以请他们进行会诊。

病理科可以开展的项目有术中冰冻、病理外检、脱落细胞学的病理诊断，脱落细胞包括痰、胸腹水，尿液、脑脊液、宫颈的TCT等。还可以开展几十项的免疫组化及特殊染色。