厦门中医院病理科于1997年成立，随着医院的病理事业不断发展，至今已基本形成集医疗与科研于一体的拥有全自动脱水机、包埋机、切片机、荧光显微镜、全自动组织切片染色封片一体机、薄层液基细胞学制片设备、DNA倍体分析设备、全自动免疫组化仪、一代基因分析仪、实时荧光定量PCR仪等现代化的大型仪器和设备的具有现代化、规模化、规范化的临床基础科室。

1997年实现信息化办公，使用图文报告系统并网络化传输，提高了工作效率；2011年数字切片及远程会诊平台正式启用，轻易便捷地实现了基于网络系统的诊断工作；2015年启用分子病理诊断相关技术平台，进一步提高了综合服务能力；2018年全年外检量超过25000例，各类细胞学标本15000余例，病理科在完成大量医疗工作外，同时承担各级科研课题的在研工作，近3年发表SCI论文1篇，国内核心期刊论文10余篇，为厦门市中医院的进步作出了力所能及的贡献。

病理科开展的工作项目主要包括：

1、全身活体组织病理检查：包括所有手术标本、身体各部位的穿刺组织标本和纤维胃镜、肠镜、支气管镜、喉镜的活体标本。

2、薄层液基细胞学检查（TCT）：开展了妇科、非妇科（痰涂片、支气管刷片、胸腹水、尿液、甲状腺、乳腺囊液等各种组织穿刺液）的液基细胞学检查技术，细胞DNA定量分析系统已运用于妇科TCT筛查，全部使用彩色图文报告，为健康普查和癌症的早期诊断提供可靠依据。

3、术中冰冻切片检查：通过使用冰冻切片的方法，可在30分钟内发送病理报告，主要用于手术过程中的快速诊断，确定病变性质（如肿瘤或非肿瘤、良性肿瘤或恶性肿瘤），以决定手术方案和了解恶性肿瘤的扩散情况等。

4、免疫组织化学检查：病理科有着成熟的免疫组织化学技术，现在常规开展近百项免疫组织化学检查项目，用于疾病的诊断和鉴别诊断，以及判断某些恶性肿瘤的转归和预后。

5、特殊染色检查：有10余种特染检查，如网状纤维染色、PAS、AB及抗酸染色等，用于疾病的诊断和鉴别诊断。

6、分子病理诊断：主要包括基因突变及测序技术，已常规用于肺癌、甲状腺癌、乳腺癌、胃癌、肠癌的基因检测，为临床治疗特别是分子靶向治疗提供依据。

7、对外科研技术服务：提供临床研究和实验研究的组织、细胞、基因及蛋白水平的技术指导以及药效学评价等。