三明市第二医院眼科于2019年10月整合原三明市第二医院眼科和永安市立医院眼科而成立，现有医护人员19人，其中主任医师2人，副主任医师6人，副主任护师1人。

眼科年门诊量约1.5万人次，年手术量约1500例，拥有美国爱尔康laureate超声乳化仪、爱尔康玻璃体视网膜手术系统、德国zeiss显微镜、zeissPRIMU200光相干断层扫描仪、zeissVISUCAM500眼底照相造影仪、zeiss视野计、zeiss532眼底激光治疗仪、综合验光仪、角膜地形图等一批先进设备。

现已开展白内障屈光手术、复杂玻璃体视网膜手术、眼底激光、激光治疗青光眼、鼻内镜下泪囊鼻腔吻合术、斜视、复杂眼外伤等手术。