三明市第二医院放疗科是2006年3月刚刚成立的科室，该科建筑面积为1897平方米，引进世界先进医科达公司PRECISE双光子全数字化直线加速器及美国CMS公司立体定向三维适形放射治疗计划系统，该系统与先进的德国西门子公司三维螺旋CT激光灯定位系统联网，从而迅速获取并建立精确的肿瘤三维立体图像，根据肿瘤图像从三维方向控制放射分布，完成精确治疗。

此外，放疗科还引进国内高清晰模拟定位机及钴－60全身肿瘤治疗机，对全身各种肿瘤进行外照射治疗。