北京大学口腔医院第二门诊部牙周科，于2005年6月1日成立，承担北京大学-香港大学牙周专业研究生临床培训任务，与国际牙周病学界联系密切、学术交流广泛。

科内医师多具有硕士、博士学位，除为患者提供洁治、刮治、根面平整术、抛光、松动牙固定、牙周翻瓣术等牙周病常规治疗外，还开展引导牙周组织再生的植骨术和引导组织再生术、治疗牙龈退缩的膜龈手术、牙周美容手术、牙齿缺失后的牙种植手术等与国际接轨的牙周专科治疗。