山东中医药大学附属医院针灸科建立于1955年，自成立之日起即聚集了在全国颇具影响的针灸名家，创立了独具特色的针灸治疗方法，1996年被山东省教育厅批准为山东省重点学科，2007年被国家中医药管理局批准为“十一五”国家重点中医专科，2009年被山东省中医药管理局批准为山东省中医药优势专科。
目前已成为全省规模大、学术水平高、特色突出、优势明显、在国内颇具影响力的临床学科，居山东省针灸专业的龙头地位。现有医师42名，其中主任医师、教授9名，副主任医师、副教授18名，博士研究生导师3名，硕士研究生导师13名。多人在中国针灸学会、山东针灸学会、山东省医学康复学会等担任职务。
针灸科是具有中医传统特色的重点发展科室之一，具备独立的门诊和病房，医院东、西两个院区都设有针灸门诊。在治疗手段上，该科开展了各种传统治疗方法，如毫针、皮内针、三棱针、头针、耳针、电针、穴位埋线、穴位贴敷、水针、拔火罐和督灸、脐灸等各种灸法，同时在长期临床和研究的基础上建立了一套较完整的治疗体系，既保留了传统特色，又不断创新。
近年来针灸疗法正以其安全、无副作用与应用范围广泛等特点，而为愈来愈多的患者所接受。其对许多疾病治疗方面所体现出的高效、速效的治疗优势，在临床中深受患者欢迎和好评。
特色优势病种
（一）内科
神经系统疾病：中风、面瘫、偏头痛、三叉神经痛、枕神经痛、肋间神经痛、坐骨神经痛、股外侧皮神经炎、桡神经损伤、腓神经损伤、外伤性不全瘫、癔症、焦虑抑郁，以及癫痫、震颤麻痹、多发性（末梢）神经炎等。
心血管系统疾病：高血压病、冠心病心绞痛、心律失常、心脏神经症等。
呼吸系统疾病：慢性支气管炎、哮喘等。
消化系统疾病：膈肌痉挛、功能性消化不良、胃肠痉挛、胃下垂、慢性胃炎、便秘、溃疡性结肠炎、单纯性阑尾炎、胆绞痛。
泌尿系统疾病：泌尿系结石、尿潴留、尿失禁等。
内分泌系统疾病：糖尿病及并发症、甲亢、肥胖症、高脂血症、高泌乳素血症等。
风湿免疫系统疾病：风湿性关节炎、类风湿性关节炎、强直性脊柱炎等。
血液系统疾病：白细胞减少症等。
（二）皮外骨伤科
痤疮、荨麻疹、带状疱疹、神经性皮炎、斑秃、落枕、颈椎病、肩周炎、腰椎间盘突出症、腰扭伤、肌筋膜炎、梨状肌综合症、膝骨关节炎、肱骨外上髁炎、腱鞘囊肿、颞颌关节炎等。
（三）妇科
痛经、月经不调、围绝经期综合症、慢性盆腔炎、子宫脱垂等。
（四）儿科
小儿遗尿、小儿脑瘫等。
（五）五官科
假性近视、麦粒肿、视疲劳综合症、耳鸣耳聋、牙痛、单纯性鼻炎、急性扁桃体炎、慢性咽炎等。
特色疗法：
（一）耳穴综合疗法治疗偏头痛
耳穴综合疗法，简称耳综疗法，是一种集耳廓按摩、耳背放血、自血穴注、耳穴点刺等于一体的综合疗法。通过多年丰富的临床经验积累，该疗法已于2001年经国家中医药管理局评定，作为全国百项中医诊疗技术项目之一进行推广。耳综疗法通过调节经络、脏腑，达到促进气血运行，疏通经络，改善脏腑功能的目的，使阴阳渐得平衡，从而起到消瘀去滞的作用，“通则不痛”。
（二）补肾强督通络针法治疗小儿脑瘫
补肾强督通络针法重养脑髓、复健脑络、健脑益智，治疗同时通过对患儿家长培训，脑瘫儿护理方法、脑瘫儿运动体操、捏脊疗法等，可有效促进脑瘫患儿康复。
（三）督灸治疗强直性脊柱炎
督灸是在督脉的脊柱段上施以隔药发泡灸以治疗疾病的一种中医特色疗法，该疗法汇督脉、药物、艾灸的治疗作用于一体，既可温肾壮骨、补精益髓，以治肾虚之本，又可行气活血、祛寒除湿、豁痰破瘀以治督滞之标，对于强直性脊柱炎（AS）等顽疾可标本兼治，效果显著。
山东中医药大学附属医院督灸治疗中心已对督灸疗法治疗AS进行了规范化研究，并于2007年5月通过国家中医药管理局专家组鉴定，2011年5月国家中医药管理局完成督灸治疗AS技术操作程序录像，将制作光盘，在全国广泛推广督灸技术，从而造福更多的AS患者
（四）温针灸治疗膝关节骨关节炎
膝关节局部疼痛是膝骨关节炎的重要症状，也是促使患者就医的主要原因，温针灸有良好缓解膝骨关节炎疼痛的作用，运用温针灸疗法，疗效明显，作用持久。
（五）针灸并用治疗周围性面瘫
针对周围性面瘫的不同时期（发展期、静止期、恢复期）并结合西医定位诊断及病情变化，针灸并用，效果显著。
（六）综合疗法治疗中风病
辨病辨证结合，头针体针共用，醒脑开窍，调脏扶正，并结合刺络叩刺及药物等方法，综合治疗中风病，能明显提高痊愈率和有效率。
（七）夹脊刺特色疗法治疗颈、腰椎病变
辨病因与病位，侧重经气疏导，根据患者病程长短、年龄长幼、疼痛部位、疼痛性质、疼痛时间等，以局部“夹脊穴”针刺为主，配合点刺放血、隔姜灸、温针灸、灸盒灸、穴位注射等综合治疗颈、腰椎病变。
（八）穴位埋线治疗单纯性肥胖症
单纯性肥胖症是指体内热量的摄入远大于消耗和利用，造成脂肪在体内积聚过多进而导致体重超常的病症。穴位埋线疗法是将医用羊肠线埋在穴位内，可被身体完全吸收，无毒副作用，随着羊肠线的缓慢吸收起到对穴位的长久刺激作用，通过经络的调整疏通作用，促进新陈代谢，取得整体减肥效果。此法一周仅需治疗一次，治疗后即可正常活动，不影响工作和生活，皮肤外观也无任何影响，疗效稳定可靠。
（九）隔药物灸治疗消化、泌尿生殖系统疾病
艾灸是针灸治疗疾病的重要方法之一，临床适应症极广。隔药物灸就是在艾绒与皮肤之间隔衬某些药物而施灸的一种方法。此法具有艾灸与药物的双重作用，火力温和，可以起到温经通络、温中散寒、温肾健脾、回阳固脱、益气升阳与消瘀散结等多种功用。治疗脾胃虚寒性病症、慢性结肠炎与溃疡性结肠炎以及痛经、卵巢囊肿、子宫肌瘤等疾病，同时对防病保健，提高机体抗病能力也有很好的作用。