烟台市毓璜顶医院消化内科为中华医学会消化内镜专科医师培训中心，中国医师协会高级消化内镜医师培训基地，中国食管胃静脉曲张诊治规范基地，国家消化道早癌防治中心联盟首批基地，省临床精品特色专科，省医药卫生重点专业，省临床重点专科，市消化系统疾病临床医学研究中心，市消化内镜质控中心。

科室综合实力居国内先进、省内领先水平。该科下设肝胆胰疾病、消化道早癌、超声内镜、静脉曲张、肠道疾病、胃肠功能性及动力性疾病与幽门螺杆菌6个亚专业。

科室人才梯队合理，现有医护人员103人，其中主任医师7人、副主任医师11人，二、三级教授2人，具有博士后/博士/硕士学历/学位者33人，博导、硕导5人。享受国务院特贴、卫生部及省突贡专家3人，全国学会副主委、委员及省级学会副主委21人，中华级期刊编委3人。开放床位174张，年门诊量7.6万余人次。出院病人1.1万余人次，平均住院天数4.7天。

消化内镜中心共开放操作间14个，年开展内镜诊治9.0万余例，其中胃肠镜检查4.9万余例，内镜下治疗4.1万余例。1998年3月在国内率先开展了急诊内镜下胃底静脉栓塞联合食管静脉曲张结扎术（EVL）治疗肝硬化大出血；2000年6月在省内较早开展了ERCP；2001年3月在省内较早开展了超声内镜技术（EUS）；2004年8月在省内率先开展了双气囊内镜技术；2008年1月开展了内镜粘膜下剥离术（ESD）、2009年5月开展了内镜粘膜下挖除术（ESE）及全层切除术（EFR）。

2013年1月开展了消化内镜隧道技术（POEM、STER），均达省内领先。现年开展双气囊内镜技术1000余例，居国内首位；年开展EUS4500余例、胃底静脉曲张栓塞术及EVL1100余例、治疗性ERCP1000余例，均居国内领先或先进；年开展ESD及隧道技术600余例，居省内领先。

近年来，科室获计划内科研课题32项，其中获国家自然科学基金3项，省自然科学基金及省科技发展计划7项。获各级科技进步奖21项，其中获省部级科技进步二等奖5项，中华医学科技二等奖是省历史上仅有的三个之一；获省科技进步三等奖及厅市级科技进步一等奖6项，省医学科技一等奖是烟台市历史上唯一一个。

发表论文307篇，其中SCI收录53篇，主编大型专著7部，2002年出版大型专著《实用消化内镜治疗学》，由人民卫生出版社再版2次。已培养博、硕士研究生42名，年接收国内外见习、实习、规培及进修医师200余人。2003年后成功主持举办了十届大型“烟台国际消化内镜手术演示会”，承办了中华医学会消化内镜学分会六届学组年会及国家卫健委组织的“第一次全国消化内镜诊疗技术普查工作总结会议”。

科室近20年连续被医院评为先进科室，综合目标考核一直居全院临床科室首位。2003年11月被山东省卫生厅授予“山东省医药卫生重点专业”称号；2004年6月被烟台市总工会授予“烟台市职工创新示范岗”称号；2009年8月经中华医学会消化内镜学分会批准为“中华医学会消化内镜专科医师培训中心”，是全国地市级医院唯一一个；2010年7月以全省评比总分第一被山东省卫生厅授予“全省卫生系统十大质量品牌科室”称号。

2010年8月被山东省卫生厅授予“首批省级医疗质量示范科室”称号；2012年5月被国家食品药品监督管理局授予“国家药物临床试验机构资格”；2013年12月被山东省卫生厅授予“山东省临床重点专科”称号；2015年1月成为“中关村（泛亚）消化内镜技术创新战略联盟”会员单位；2017年8月被中华医学会消化内镜学分会授予“中国食管胃静脉曲张诊治规范基地”称号。

2017年12月被山东省卫健委等多部门评为21个“山东省临床精品特色专科”之一，是全省同专业唯一一个；2018年7月被国家卫健委及中国医师协会内镜医师分会联合授予“中国医师协会高级消化内镜医师培训基地”称号。

2018年7月被国家卫健委、国家消化内镜质控中心、国家消化系统疾病临床医学研究中心、中国医师协会内镜医师分会、中国健康促进基金会、中国抗癌协会肿瘤内镜专委会联合授予“国家消化道早癌防治中心联盟首批基地”称号；2018年10月被烟台市科技局批准成立“烟台市消化系统疾病临床医学研究中心”。