昆明医科大学附属儿童医院是云南省唯一一所集医疗、科研、教学、保健、康复为一体的三级甲等儿童专科医院，前身是1920年英国教会(中华圣公会)创办的“惠滇医院”；1950年，由昆明市人民政府接管，改名为“昆明陆军医院妇产分院”；1958年改建为昆明市儿童医院。2011年获批成为昆明医科大学附属儿童医院，2014年医院通过三级甲等专科儿童医院评审，2020年通过三级甲等专科儿童医院复审；2015年成功荣获市长质量奖；2019年医院在三级公立医院考核儿童医院全国排名第九，其中CMI排名第七，四级手术人数排名第十二；艾力彼智慧医院排名46，是云南省唯一一家进入百强的医院；复旦排行榜西南地区小儿内科第三，小儿外科第四。
医院有前兴和书林两个院区，总占地面积126亩，业务用房面积12万平方米；编制床位900张，实际开放床位1200张；医院年门、急诊总量达200万余人次，年住院量超6万余人次，年手术量2万余人次；现有在职职工1962人。其中：博士研究生17人，硕士研究生283人；正高级职称77人，副高级职称165人，中级职称608人。医院设置有71个科室、部门，其中：临床科室39个，医技科室8个，职能部门24个。
医院学科特色鲜明，涵盖了除产科以外的所有儿科亚专业，是昆明医科大学附属儿童医院，是云南省儿童医学中心，云南省儿科疾病临床医学中心，云南省儿科研究所，云南省儿童重大疾病研究重点实验室，云南省儿童健康与疾病临床医学研究中心，云南省新生儿疾病研究中心，云南省博士后科研工作站，国家药物临床试验机构。医院现有云南省儿童听力障碍及语言疾病综合防治创新团队1个，云南省专家工作站5个；国家临床重点专科1个，省级医学重点专科9个，市级医学重点专科4个。医院是云南省新生儿科医师培训基地，是国家住院医师规范化培训基地，含儿科和儿外科专业基地，国家专科医师规范化培训基地，含新生儿围产期医学和儿科麻醉学专科基地；是云南省住院医师规范化培训结业考核考点；2020年9月获批成为国家住院医师规范化培训儿科重点专业基地。每年接收来自全省各地州县级医院送培的住院医师、新生儿专科医院、儿科医护人员及技师300余人，为全省培养儿科医学专业人才。
近5年医院获得各级各类科研项目立项267项，发表论文1531篇，出版专著93篇，发明专利1项，实用新型专利204项，外观设计专利1项，科研获奖项目21项，新增委员任职152人，举办继教项目242次，国务院特殊津贴1人，全国先进工作者1人；全国医药卫生系统先进个人1人；省政府特殊津贴2人，省级突出贡献奖3人，市级突出贡献奖6人。获得云南省科技进步二等奖2项，三等奖3项；云南省卫生科技成果奖二等奖2项，三等奖6项。享受云南省万人计划“名医”专项3人、云南省高层次人才培养支持计划“青年拔尖人才”专项1人、云南省先进工作者1人；云南省卫生系统先进个人1人；云南省中青年学术和技术带头人3人、云南省技术创新人才1人、云南省卫生高层次人才领军人才1人，医学学科带头人3人、后备人才4人。昆明市“春城计划”各类人才18人；劳动模范1人；第二届优秀科技工作者1人；昆明市中青年学术技术带头人3人、昆明市中青年学术技术带头人后备人选4人，昆明市卫健委科技人才培养“十、百、千”工程共计143人。