医院前身为1954年10月成立的新疆军区生产建设兵团运输处卫生科门诊部，60多年来，跟随兵团发展改革的步伐，医院在定位、规模、地点及名称等方面历经了十次变革，最终于1982年6月正式更名为新疆生产建设兵团医院。目前，医院已发展成为兵团设在新疆首府乌鲁木齐市唯一一所集医疗、教学、科研、预防、保健、应急于一体的综合性三级甲等医院，是新疆医科大学、石河子大学医学院的教学医院，承担着兵团、自治区、乌市广大人民群众的医疗保健，担负着兵团及全疆疑难危重疾病的诊治以及突发公共卫生事件的救治和兵团民兵应急救护任务。

目前医院本部占地面积3.5万平方米，业务用房面积8.4万平方米，编制床位800张，开放床位900张。设有27个临床科室，13个医技科室，13个辅助科室。拥有享受国务院政府特殊津贴专家6人，兵团突出贡献专家2人，兵团学术技术带头人1人，全国名中医、兵团名中医1人。

兵团医院是国家级住院医师规范化培训基地（16个专业），拥有1个国家级重点专科（医学检验科，2014年1月成为ISO15189认可实验室），3个国家级医学中心（胸痛中心、高级卒中中心、房颤中心），9个省级临床重点专科（心血管内科、呼吸内科、中医科、重症医学科、骨科中心、医学检验科、医学影像科、麻醉科、临床护理），2个省级医学中心（兵团眼科中心、兵团呼吸中心），10个省级质量控制中心（兵团心血管疾病介入诊疗质量控制中心、兵团临床检验专业质量控制中心、兵团临床输血质量控制中心、兵团消毒供应质量控制中心、兵团药事管理质量控制中心、兵团呼吸内科医疗质量控制中心、兵团脑卒中医疗质量控制中心、兵团单病种质量控制中心、兵团医学影像质量控制中心、兵团临床路径质量控制中心），6个兵团（省级）培训基地（兵团PICC专科护土培训基地、消毒供应从业人员培训基地、血液透析专科护士培训基地、骨科专科护士培训基地、糖尿病专科护士培训基地、中医护理适宜技术培训基地）。

自2010至今，共有17家医院对口支援兵团医院，先后派出援疆专家共计173人，涉及近30个专业。目前，北京协和医院、北京医院、广安门医院、中日友好医院、中科院阜外医院、天津市人民医院、天津眼科医院、天津中医药大学第一附属医院和天津医科大学第二医院9家医院的14名援疆干部在我院挂职。

长期以来，在各援疆单位和专家的支持下，兵团医院成为“国家呼吸联合研究中心·中日医院·兵团呼吸专科医联体”、成为“国家远程医疗与互联网医学中心——新疆兵团协同中心”，加入了北京协和医院骨科牵头的国家手术机器人协作项目并成为新疆地区唯一协作单位，兵团医院眼科作为首批合作单位加入北京协和医院眼科读片中心、远程会诊中心和眼科专科医联体，首批加入中日友好医院肾脏病专科医联体，加入天津市人民医院远程病理会诊中心等。

全面贯彻落实党中央、国务院、兵团党委关于深化医药卫生体制改革要求，构建以兵团医院为核心，整合十一师、十二师医疗机构共同参与，补齐学科发展短板，逐步形成兵团乌鲁木齐区域医联体的总体战略布局（包括一院三区七家成员单位），不断满足兵团乌鲁木齐区城居民优质医疗资源的需求。

目前兵团医院医疗设备不断更新，拥有大量的高精尖设备：东芝320排（640层）CT机、联影320排（640层）CT机、GE3.0T磁共振、飞利蒲1.5T核磁、瓦立安CX系列直线加速器、西门子全数字平板探测X线数字减影机（DSA）、双平板DR摄片机、 超乳一体机及手术显微镜，用来完成泌尿系统手术的大功率钬激光和绿激光及碎石机、4K高清腹腔镜及3D高清腹腔镜，奥林巴斯超声高清胃肠镜，富士超声支气管镜等。国家级重点实验室检验临检中心拥有四重多联杆质谱仪、罗氏C8000化学发光生化仪、二代基因测序仪等检验设备。

兵团医院在兵团党委、兵团卫生健康委党组的支持与指导下，医院的诊疗技术、服务能力稳步提升。面对新的机遇与挑战，兵团医院将加紧发展步伐，继续发挥省级综合医院的优势，发展成为总体布局合理，资源配置优化，专科特色突出，综合救治能力强劲，科教成绩显着，患者满意度攀升，员工幸福感不断提升的高水平医院。