福建省中医药科学院(原福建省中医研究所)始创建于1957年，系省属公益类中医药科研事业单位，为福建省省属中医药科研机构，位于福州市鼓楼区五四路282号。主要开展中医药基础与临床研究，承担新药的临床研究工作，开发山海药物资源，开展中医药的对外交流等工作。是福建省青草药开发服务中心、福建省中医药科学院中医药技术转移中心、福建中医药大学保健食品研发中心。

科学院下设经络研究所、药物研究所、基础研究所、临床医学研究所、科技产品研发中心、比较医学中心、台湾牛樟芝大陆研发中心及台湾产特色植物大陆研发中心等，并附设综合门诊部、福州鼓楼三利得健康产业发展有限公司和职业技能鉴定站。

全院现有职工200余人，拥有一批国务院特殊津贴、国家级和省级名老中医学术继承人指导老师、福建省全国中药特色技术传承人才培训项目培养对象、省级突出贡献中青年专家、省名中医等中医药优秀人才。

拥有国家中医药管理局重点研究室、国家中医药管理局三级实验室、省级各类重点实验室、研究室、基地及工程技术研究中心等30余个各级各类科研平台。