重庆市万州区上海医院成立于1961年，原名重庆市万州区第五人民医院。2013年9月成功创建国家二级甲等综合医院，2019年5月16日正式更名为重庆市万州区上海医院。医院是上海市目前对口支援全国各省市区卫生健康事业中唯一一所以“上海”冠名的公立医院。
医院现有在职职工553人，高级技术人员56人，中级技术人员158人，研究生10人；编制床位450张。年住院病人3万人次，年总诊疗50万人次。医院目前设有一个门诊部、一个住院部。设呼吸、心血管、消化、肾内、普外、泌尿、骨科、妇科、产科、耳鼻咽喉科、白玉兰血液透析中心等临床一、二级学科25个，独立病区11个，医技科室7个。医院突出专科专病特色建设，拥有重庆市级特色专科耳鼻咽喉科、万州区级特色专科骨科。
医院拥有1.5T核磁共振设备、64排GECT、16排东软CT、四维彩超、800个/小时测试速度全自动生化分析仪等大型设备。
2014年6月医院成功创建成为重庆三峡医药高等专科学校教学医院。复旦大学附属金山医院、上海交通大学医学院附属瑞金医院卢湾分院、上海市浦东新区公利医院是我院对口支援合作及技术指导医院，通过技术协作、学术交流、人才培养等合作方式，加快了医院的技术进步和学科发展的步伐，进一步提高了医院的服务功能和服务水平。
医院先后获得“市民满意医院”“民众喜爱医院”“万州区先进基层党组织”，获重庆市总工会2017年“五一劳动奖状”，获2017年“万州区扶贫攻坚工作成效显著集体”，2020年中共孝感市委、孝感市人民政府“爱心团队”等荣誉称号。
在区委区政府的大力支持下，医院2021年争取到新院区建设项目，新院区位于万州经开区五桥园（天星片区），占地面积约120亩，总建筑面积20万方，按照三甲医院标准1000张床位规模总体设计，分期建设。其中一期工程总建筑面积14万平方米，设置床位600张，建设年限2022年-2024年。