内蒙古杭锦后旗医院始建于1952年，发展到今天有65年的光辉历程。由人民政府举办，隶属于卫生局管理，经过60多年的改革、创新、发展，现已成为一所集医疗救治、预防保健、康复治疗、人才培训、科教研于一体的国家二级甲等医院，承担着全旗三十三万人口并辐射到乌拉特后旗等周边地区广大农牧民的医疗健康重任。是巴彦淖尔市“120急救中心”和本旗“急救绿色通道”，是医保、农合、交通肇事、工（公）伤鉴定指定医院。
医院占地面积31369平方米，总建筑面积38300平方米，开放床位500多张，有骨病创伤中心、外科急诊大楼、内科医技大楼、独立的传染病区四处医疗服务场所。设有临床、医技、药学、行政等50多个科室，科室设置齐全，专业分工细致，技术力量雄厚。开展的主要业务有：心梗溶栓治疗、脑梗溶栓治疗、颅内血肿微创手术、腹腔镜手术、宫腔镜手术、膀胱镜手术、血液透析、肿瘤化疗、高压氧治疗、碎石治疗、直肠镜、重症监护、中医康复治疗等。2015年与北京同仁眼科医院研究所合作并成为眼科远程会诊基地；2016年与首都医科大学宣武医院合作开设疼痛专科并成为示范基地。
医院在岗在职564人，其中高级技术人才94人，中级118人，研究生3人。门急诊人次每日平均610人左右，住院人次平均每日50人左右，病床使用率89.1%。大中手术2000多例，抢救危重病人成功率达95%以上。
现医院拥有最先进的层流净化手术室、进口麻醉机、外科超声刀、腹腔镜、宫腔镜、电切镜、全身CT、CR、DR、C型臂X光机、彩色多普勒、全自动生化分析仪、血球计数仪、电子胃镜肠镜、血透机、碎石机、高压氧舱、康复治疗仪、呼吸机、监护仪、呼叫器；新近购置美国GE1.5T核磁共振、全身螺旋CT、飞利浦EPIQ7彩超、大型口腔CT、数字化乳腺钨靶X线摄影机、全自动生化分析仪等国际先进仪器设备，并与国内各大医院、知名专家长期建立技术协作关系，为全旗老百姓的健康保驾护航。