南京医科大学附属眼科医院汉中路院区乘坐地铁2号线在上海路站2号出口；公交车:5,9,13,18,29路莫愁路站; 3,43,48,83路五台山站。

南京医科大学附属眼科医院六合院区：S8号线坐到雄州站（2号口出），乘坐公交D66路/622路/D67路至马营南站下车或乘坐公交502路/624路/617路/526路/616路外圈/627路至马营东站下车。