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胃肠功能紊乱为功能性疾病，对人体影响不大。病人可表现为极度不适，但一般预后良好。由于胃肠功能紊乱治疗与患者精神因素及心理因素有关，因此治疗较为困难，可反复出现。经调解情绪、调整饮食及药物对症等系统治疗，一般均可缓解症状，并且维持一段时间不发作，但能否完全根治因人而异。若出现胃肠功能紊乱相关症状，建议及时就诊对症用药。