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新生儿呼吸窘迫综合征在早期表现为原发疾病相关的一些临床表现，比如由严重感染引起，患儿主要表现为发热、感染、中毒的症状。由于脓毒性休克所引起，患儿可能早期主要表现为循环功能衰竭的相关临床表现。早期患儿没有肺功能不全的相应的临床表现，随着病情的进展，可能在原发病的基础上出现病情的急剧恶化，表现为烦躁不安、进行性呼吸窘迫、发绀、呻吟、呼吸困难以及难治性低氧血症，肺部听诊可能听到干性啰音或者湿性啰音。随着缺氧进一步加重，可能会引起肺外的相关系统的表现，如脑缺氧可能会引起意识障碍改变，甚至引起抽搐、惊厥，心脏循环缺氧可能引起心率增快等相应的循环系统表现。