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功能性腹泻的预后一般是良好的，功能性腹泻一部分因素是因为菌群失调、菌群紊乱，另一部分是精神叫自身神经系统调节紊乱而导致的，预后都是良好的。功能性腹泻如果不针对病因进行干预，有一部分患者长期腹泻就会导致低钠、低钾，甚至消瘦的临床情况发生。临床当中遇到患者长期腹泻，出现乏力、没有精神、起不来床，甚至有心跳加速，要判断是不是发生了电解质紊乱出现低钾甚至低钠，需要进行临床干预补充电解质改善症状。