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双肾有囊肿如果是成年人后天获得性单纯肾囊肿，不需要治疗，因为是良性病变、正常衰老表现，跟白头发、皱纹一样类型，为正常生长过程之中表达出来的，可以理解为生命体的正常发展，不需要治疗。但是先天性多囊肾，双肾囊肿是多发的，个头巨大、生长迅速，同时有背景史、家族史，可能存在先天性多囊肾，这是一类遗传性的肾脏囊性疾病，这部分肾囊肿需要治疗。​治疗也不是基于遗传基因背景来治疗，因为目前没有这方面药物，而是基于肾囊肿出现的合并症治疗，比如高血压治疗、水肿治疗、尿液异常治疗、肾功能衰竭治疗。最终先天性、遗传性多囊肾，多数病人都会走入到尿毒症期，而后天获得性、单纯性肾囊肿是良性病变，不会影响到肾功能。