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婴儿心肌酶高是否能自愈要根据具体情况决定，具体如下：1、婴儿心肌酶轻度升高：这部分升高的心肌酶可以自然愈合，不需要特殊处理；2、疾病导致心肌酶升高：如上呼吸道感染导致心肌细胞功能受抑制，随着感染的控制，心肌酶可以自行恢复正常；3、心肌酶升高明显：肌钙蛋白已经出现不同程度的升高，提示心肌细胞可能有变性、水肿、坏死，此时无法自愈，同时要加强警惕，带孩子来医院做心脏其他方面检查，比如完善心电图，明确孩子是否出现各种心律失常，做心脏超声检查，明确心脏结构、大小、功能有无出现异常。一旦发现孩子心肌发炎，导致心肌酶出现异常升高，要积极处理，使炎症在短时间内得到有效控制，尽量让孩子经过积极的治疗之后痊愈，甚至部分得到较好的控制，尽量不遗留严重、永久的心脏相关后遗症。