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脑炎治疗时期与病毒感染毒力、患者情况、感染类型都密切相关。通常治疗时间需2-4周，也就是在2-4周内临床症状缓解，达到临床痊愈，一方面和病毒感染程度、类型、毒力，患者本身抵抗力都密切相关，所以痊愈时间是个体化。通常建议中枢神经系统治疗时间一定要足量、足疗程，病毒感染引起的脑炎至少治疗应当3周以上；如果是结核性脑炎，疗程可能更长；还有其它特殊感染，比如布氏杆菌感染，治疗周期可能要半年以上；还有霉菌等感染，要达到病毒转阴，临床痊愈可能需半年，甚至更长时间。