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孩子的身材矮小，需要进行以下几方面检查：1、神经系统检查：如果垂体出现病变，生长激素、甲状腺激素等分泌不足，会出现身材矮小；2、基因检测：如果出现家族性矮小，有些孩子的父亲低于1.60m，母亲低于1.50m，家族性矮小需要进行基因检测；3、骨龄：可以进行左手的手指到手腕的正位片检查，观察骨骼发育，从而推测骨龄；4、发育水平：如果存在不同的发育程度、发育状态，可能与身高密切相关；5、其它检查：例如常规肝肾功、血糖等，以及某些特殊疾病导致身材矮小的排查，如果出现贫血、营养素缺乏等，也会出现因为营养不良性的身材矮小，内分泌疾病例如生长激素缺乏、甲状腺激素缺乏等也会导致身材矮小。