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儿童矮小症需要做以下的检查项目：1、体格检查：当前的身高、体重、外观、第二性征发育的情况，还有全身各系统检查等；2、实验室检查：包括血、尿、便常规，以及肝功能、乙肝两对半、肾功能、电解质、甲状腺功能、血脂、血糖、骨龄，还有头颅核磁共振、生长激素激发试验、胰岛素样生长因子-1、胰岛素样生长因子结合蛋白-3检查等；3、特殊检查：此外，根据患者病情可做特殊检查，如IGF-1的生成试验、皮质醇、ACTH、性激素、戈那瑞林激发试验、绒毛膜促进性激素试验、血气分析、骨密度、25-羟维生素D，以及头颅、胸部、脊柱、骨盆、四肢长骨X光摄片，女孩还必须要做染色体核型。检查项目需根据医生的诊断需求，因为每一个项目，都有它必须要做的意义。