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通常治疗幽门螺杆菌需要四种药联合应用，均可产生副作用，但总体而言较安全，通常只要符合治疗适应症，大部分人可以耐受。对于部分年龄较大患者，需要特别警惕药物对于肝肾功能的影响，常见不良反应如下：1、口苦：如克拉霉素作为一种抗生素，大部分患者服药时会觉得口苦，但口苦感可随治疗结束逐渐消失；2、黑便：如部分患者口服含有铋剂胃黏膜保护剂后可出现大便颜色发黑、大便次数多等表现，但并非所有人均出现不良反应；3、其他副作用：药物可能对肝功能存在一定影响，部分患者还可出现过敏反应，如部分患者对青霉素过敏，服药后可出现药物性皮疹等反应。除此之外，如药品说明书上可能出现较罕见的副作用，临床相对较少见。