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肾盂肾炎常见的致病菌主要包括大肠埃希菌、肺炎克雷伯菌、变形杆菌和绿脓杆菌，分析如下：1、大肠埃希菌：肾盂肾炎的感染途径，可以是逆行感染，也就是致病菌沿着尿道、输尿管上来，这个大多数是大肠埃希菌；2、变形杆菌：有些疾病和结石有关系，这个就是常说的变形杆菌。因为变形杆菌可能是和另外一种古老的细菌，也就是纳米细菌结合在一起，纳米细菌感染了变形杆菌之后，就容易形成钙化的骨架。所以，变形杆菌和结石的形成有一定的关系；3、肺炎克雷伯菌：肺炎克雷伯菌通常是循着血液循环到达肾脏，然后导致肾盂肾炎的发生；4、绿脓杆菌：常见的就是铜绿假单胞菌，就是平时所说的绿脓杆菌，这个菌通常是和插尿管或者其他的器械操作有一定的关系。以上就是肾盂肾炎常见的四种致病菌，可以通过尿培养来确定到底是哪一种致病菌，从而给予一个针对性的治疗。