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磁共振是主要的胶质瘤诊断方法，虽然不能100%确诊胶质瘤，但通过多种磁共振序列的分析，如T1加权、T2加权、T2加权FLAIR像、增强核磁和磁共振频谱分析，又被称为MRS因素考量，对于胶质瘤可以基本上达到90%以上的确诊率。通过磁共振影像，可以判断胶质瘤的范围、恶性程度以及生长方式，是多中心的还是单中心的。对于在T1加权、T2加权和增强上难以评估的情况，可以利用MRS磁共振频谱分析进行评估。如果CHO/NAA的比值高于1-2，可以初步断定为胶质瘤。在极少数情况如果磁共振难以辨别，可能需要PET磁共振或PET-CT来辅助诊断。因此在现有的医疗条件下，胶质瘤的诊断基本上可以达到90%以上的准确率。