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用核素碘-131治疗甲状腺疾病以后，最大的副作用就是造成甲状腺功能减退症。核素碘-131治疗甲状腺的某些疾病，包括弥漫性甲状腺肿伴甲状腺功能亢进症、某些甲状腺结节、甲状腺癌，患者不愿意进行药物治疗或者手术治疗，均可以采用核素碘-131治疗。碘-131治疗属于靶向性治疗、精准治疗，治愈率高，复发率低，是患者常选用的方式之一。碘-131的β射线射程短，对甲状腺以外的组织一般没有太大伤害。而碘主要聚集在甲状腺内，其他组织对碘没有聚集的能力。所以使用的放射性核素碘大部分都聚集在甲状腺，而且放射线又比较短，对甲状腺以外的组织没有造成一些伤害。使用碘-131治疗甲状腺疾病以后，一般最常见的副作用是产生甲状腺功能减退症。这是由于在使用的过程中，如果量少，原发疾病没有控制，使用的量稍微多一点，就容易发生甲状腺功能减退症，这个在临床上是认可的，可以用左甲状腺激素替代治疗。