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干扰素是针对乙肝病毒复制抗病毒治疗中，比较有效的抗病毒药物，但并不是所有大三阳患者都适合干扰素治疗。在选择合适的患者应用干扰素的时候，能获得比较好的效果，使病毒的复制指标转阴，甚至能使表面抗原转移，所以大三阳打干扰素有成功转阳的可能。干扰素一般应用于提高病毒的转移率的时候，只适用于患者转氨酶高的情况，通常转氨酶需要在80-400U/L，转氨酶高说明体内有肝脏有炎症损伤，但是也不能太严重。另外，病毒量比较低，表面抗原水平比较低的患者，即3000IU/ml以下的情况下，说明体内的病毒含量比较低，而且需要胆红素正常的情况下，应用干扰素才能得到比较好的效果，使HBV-DNA降到正常水平以下，而且会出现e抗原的转换，即大三阳转成小三阳。甚至有的患者会出现表面抗原的转换，就是表面抗原转阴，表面抗体出现，此时停止应用干扰素以后，病毒不容易反弹，而且肝功能稳定，这种状态就是发生乙肝病毒的临床治愈，为最好的治疗效果。干扰素抗乙肝病毒，主要发挥的除了直接抗病毒作用以外，能刺激机体的免疫系统，发挥抗病毒的作用，得到持久的免疫控制。停用干扰素以后，病毒不容易反弹，而且干扰素含有抗纤维化，能够起到预防肝癌的作用。