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异常凝血酶原是临床上比较常用的肝癌肿瘤指标，部分肝癌患者异常凝血酶原很高。而且随着肿瘤的进展或者治疗有效之后，异常凝血酶原也会相应进行变化、波动，所以异常凝血酶原是肝癌的肿瘤指标。但并不是所有的肝癌患者异常凝血酶原都会高，而且也不是所有异常凝血酶原高的患者都有肝癌的存在。正常肝细胞合成的凝血因子是正常的凝血因子，但当出现维生素K缺乏的时候，就不能合成正常的凝血因子，而只能合成没有凝血功能的异常凝血因子，包括异常凝血酶原。而肝癌患者的肝细胞不是正常肝细胞，不能合成正常的凝血因子，只能合成异常凝血酶原。因此部分肝癌患者异常凝血酶原很高，则是帮助进行诊断的指标。但是除了肝癌之外，还有其他因素会引起异常凝血酶原合成增高。比如使用特殊的药物，双香豆素类抗凝剂，如华法林。使用华法林的患者，由于维生素K吸收障碍，所以患者也可能出现异常凝血酶原明显升高的情况。当然对于其他因素，比如长期使用抗菌素，特别是头孢类抗菌素，以及严重的肝功能失代偿患者，或者是维生素K肠道吸收功能障碍的患者，同样因为维生素K的摄取不足而导致异常凝血酶原合成的增加。而上述因素并不是肝癌的情况，因此诊断不能单看异常凝血酶原的指标，还有综合考虑其他的肿瘤指标，如甲胎蛋白等。另外还有影像学的检查，如CT、磁共振，以及患者是否有肝炎的背景，还有穿刺活检病理检查等，做出综合的诊断。