携带α1抗胰蛋白酶缺陷等位基因者，患结直肠癌的危险增加3倍，吸烟将促进这种危险。
美国明尼苏达州mayo医院yang医师等检测了161例结直肠癌患者和191位对照者的α1抗胰蛋白酶缺陷等位基因状况，并对结直肠癌患者微卫星不稳定表型和蛋白质表达情况进行了测定。研究者发现，在高微卫星不稳定结直肠癌患者中，α1抗胰蛋白酶缺陷等位基因携带者，显著多于低微卫星不稳定肿瘤或稳定微卫星肿瘤患者及对照组。对年龄、性别、吸烟史进行校正后，携带α1抗胰蛋白酶缺陷等位基因者，发生高微卫星不稳定结直肠癌的相对危险为3.1。研究者注意到，目前仍吸烟者，发生高微卫星不稳定结直肠癌的相对危险为6.6，而只有吸烟史者为2.7。但如果吸烟者同时又携带α1抗胰蛋白酶缺陷等位基因，则发生高微卫星不稳定结直肠癌的危险，比既不吸烟又不携带此基因者大20倍。（mol genet metab 2000，71∶639）
α1抗胰蛋白酶缺陷等位基因会增加患结直肠癌的危险尚未见报道，其可能解释是，许多携带α1抗胰蛋白酶缺陷等位基因者在达到高微卫星不稳定结直肠癌患病高峰年龄之前，便死于慢性梗阻性肺病或肝病。另一个可能是因为结直肠癌相对常见，因此，携带α1抗胰蛋白酶缺陷等位基因者患结直肠癌并没有引起注意。
另外，研究者还提出，虽然携带α1抗胰蛋白酶缺陷等位基因者，发生结肠癌的危险小于家族性腺瘤样息肉病，或遗传性非息肉病性结直肠癌病人，但前者比后两者更常发生基因改变。因而，这些疾病发生结直肠癌总的危险有可能是相等的。
