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目前治疗乙肝病毒的药物主要是抗病毒药物，这类药物包含了干扰素以及核苷类药物。干扰素的不良反应较多，且病人使用后的价格昂贵，因此较少使用，主要针对急性肝炎、病毒复制率明显升高时用于控制病毒。此外，核苷类药物是目前使用较广泛，其中最常见的有恩替卡韦、替诺福韦、阿德福韦和拉米夫定。但针对拉米夫定，由于耐药率较高，现在主要使用的还是恩替卡韦和替诺福韦。抗病毒药物需要长期使用，通常建议至少3年以上，因为停药后病毒容易出现反跳。在使用过程中，必须监测乙肝病毒的DNA，查看病毒复制率是否被有效控制。如果控制不佳，可能需要更换药物或增加其他抗病毒药进行治疗。同时，还要关注乙肝病毒是否引起了肝功能异常。如有肝功能异常，还需结合使用保肝药物进行治疗。