诊断梅毒时，梅毒化验不能取代详细询问感染史和认真的体格检查。只有在掌握了患者的个人生活史及体查的基础上，综合分析梅毒化验结果，医生才能得到正确的诊断。
至于晚期梅毒患者，TPHA试验一般为阳性，但约1/3的RPR试验为阴性。故诊断梅毒时，如单做 RPR试验，不仅在诊断一期梅毒，而且在诊断二期和晚期梅毒时，均容易漏诊。因此，当您拿到阴性结果的梅毒化验报告单时，不要高枕无忧。若近期有过不洁性交史及生殖器等部位出现较硬的单个或多个结节或溃烂时，宜每隔l-2周反复多次化验，以免因化验结果假阴性造成漏诊，耽误治疗。以往有过不洁性关系，怀疑患有二期或晚期梅毒的患者，宜同时做RPR(筛选)和 TPHA(证实)试验。梅毒化验结果是诊断梅毒的重要依据，但并非惟一依据。
目前已知，梅毒血清学检测，一般在下疳出现最初几天内RPR试验会是阴性，这主要是血清内抗体的量还不够多。硬下疳出现l-2周后，RPR试验才转为阳性。RPR试验与TPHA试验相比，前者阴转阳的时间约晚1周左右。因此，感染时间不长的一期梅毒患者，体内还未来得及产生这两类抗体，血清学检查可能为阴性。感染时间稍长的二期梅毒患者，虽大多梅毒血清学试验为阳性，但有报道，也有约 8%患者的 RPR试验结果为阴性。
为什么确诊梅毒但化验结果却是阴性呢?这是因为人感染海毒后，体内会产生两种抗体。一种是直接针对梅毒螺旋体抗原的特异性抗体，还有一种是针对类脂质抗原的非特异性抗体。医生常通过检查血液中是否存在这两种抗体，帮助诊断梅毒。RPR试验(快速血浆反应素环状卡片试验)，是检测类脂质抗体的试验，又称筛选试验，而TPHA试验(梅毒螺旋体血凝试验)则为直接检测梅毒螺旋体抗体的试验，又称证实试验。患梅毒后，并非一定能检测出这两类抗体。
